Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bp5lQ99LH9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sh3bp5lQ99LH9 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms