Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed9Q99KF1 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed9Q99KF1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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