Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pacsin3Q99JB8 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms