Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CntrobQ8CB62 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms