Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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Atg16l1Q8C0J2 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Atg16l1Q8C0J2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Atg16l1Q8C0J2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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