Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fbxo38Q8BMI0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fbxo38Q8BMI0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fbxo38Q8BMI0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fbxo38Q8BMI0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fbxo38Q8BMI0 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fbxo38Q8BMI0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fbxo38Q8BMI0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms