Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrfn4Q80XU8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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