Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Lrrc1Q80VQ1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Lrrc1Q80VQ1 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Lrrc1Q80VQ1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrc1Q80VQ1 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrc1Q80VQ1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms