Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmeff1Q6PFE7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmeff1Q6PFE7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms