Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Arhgap20Q6IFT4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms