Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop58Q6DFW4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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