Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ccdc18Q640L5 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc18Q640L5 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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