Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema3cQ62181 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms