Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem40Q4FJU9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem40Q4FJU9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem40Q4FJU9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem40Q4FJU9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem40Q4FJU9 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms