Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gpr55Q3UJF0 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gpr55Q3UJF0 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms