Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Puf60Q3UEB3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Puf60Q3UEB3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms