Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hvcn1Q3U2S8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hvcn1Q3U2S8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hvcn1Q3U2S8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hvcn1Q3U2S8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hvcn1Q3U2S8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hvcn1Q3U2S8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hvcn1Q3U2S8 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hvcn1Q3U2S8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hvcn1Q3U2S8 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms