Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccndbp1Q3TVC7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms