Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ctse-201ENSMUST00000073350 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TrioQ0KL02 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms