Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms