Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox12Q04890 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms