Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms