Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp9xP70398 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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