Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxd13P70217 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Hoxd13P70217 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd13P70217 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Hoxd13P70217 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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