Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Csrnp3P59055 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csrnp3P59055 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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