Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtpreP49446 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PtpreP49446 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtpreP49446 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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