Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms