Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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