Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PdgfraP26618 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms