Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SftpcP21841 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SftpcP21841 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms