Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms