Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DffaO54786 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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DffaO54786 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DffaO54786 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DffaO54786 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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