Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Opn1mwO35599 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Opn1mwO35599 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Opn1mwO35599 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms