Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r34G3XA52 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms