Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm28048F7BCN0 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm28048F7BCN0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm28048F7BCN0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm28048F7BCN0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm28048F7BCN0 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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