Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Gm17175E9Q528 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Gm17175E9Q528 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm17175E9Q528 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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