Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprfA2A8L5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprfA2A8L5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprfA2A8L5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprfA2A8L5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprfA2A8L5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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PtprfA2A8L5 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprfA2A8L5 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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