Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CcniQ9Z2V9 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms