Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Psmb3Q9R1P1 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Psmb3Q9R1P1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms