Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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