Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Hmg20aQ9DC33 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Hmg20aQ9DC33 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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