Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fip1l1Q9D824 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms