Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smurf1Q9CUN6 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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