Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdm1Q9CQK3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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