Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SrrtQ99MR6 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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