Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab11fip3Q8CHD8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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