Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc43a2Q8CGA3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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