Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms