Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tnfsfm13Q8BXS2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tnfsfm13Q8BXS2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tnfsfm13Q8BXS2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tnfsfm13Q8BXS2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Tnfsfm13Q8BXS2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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