Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Psme4Q5SSW2 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Psme4Q5SSW2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Psme4Q5SSW2 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms